医学院是高等院校发展的压舱石和稳定器。安徽有120所大学，其中31所公立本科大学、985中国科学技术大学，211合肥工业大学、安徽大学。
安徽医科大学，安徽医科大学是安徽省办学历史最早的高等学校之一，是安徽省第一所高等医科院校。学校前身是1926年始创于上海的东南医科大学，1949年响应中共中央华东局“面向农村，走向内地”的号召，内迁安徽怀远。1952年定址合肥，改名安徽医学院。1985年更名安徽医科大学。学校现有梅山路、翡翠路、东校区等3个校区。在职教职医护员工（含直属附院）1.52万人，其中校本部教职工1816人，专任教师960人。拥有研究生学院、基础医学院、公共卫生学院、口腔医学院、卫生管理学院、药学院、护理学院、马克思主义学院、生命科学学院、生物医学工程学院、第一临床医学院、第二临床医学院、巢湖临床医学院、国际教育学院、人文医学学院、继续教育学院、第五临床医学院、精神卫生与心理科学学院、法学院、临床药理研究所等20个直属教学机构。拥有安徽医科大学第一附属医院、安徽医科大学第二附属医院、安徽医科大学附属口腔医院、安徽医科大学附属巢湖医院、安徽医科大学附属阜阳医院等5所直属附属医院，非直属附属医院：附属省立医院（安徽省立医院），第三附属医院（合肥市第一人民医院），附属合肥医院（合肥市第二人民医院），附属安庆医院（安庆市立医院），附属六安医院（六安市人民医院），附属宿州医院（宿州市立医院），附属妇幼保健院（安徽省妇幼保健院），附属儿童医院（安徽省儿童医院），附属心理医院（安徽省精神卫生中心）。截至2022年底，实有床位数3.16万张，医护人员总量3.7万人，江淮名医115人，国家临床重点专科14个，省级临床重点专科103个，国家级重点学科1个，省级重点学科3个，年门诊量1481.2万人次，构建起覆盖全省、辐射周边、贯穿“全生命周期”的安医系健康服务体系。目前学校全日制在校生总规模为2.48万人，其中在校本科生17187人，硕士研究生6713人，博士研究生644人，留学生341人。学校医学及相关学科门类齐全，已形成学士、硕士、博士完整的教育培养体系。现有临床医学、药学、基础医学、公共卫生与预防医学4个博士学位授权一级学科，45个博士学位授权二级学科；有14个硕士学位授权一级学科，80个硕士学位授权二级学科；拥有1个博士专业学位类别，8个硕士专业学位类别。建有药学、临床医学、公共卫生与预防医学、基础医学4个博士后科研流动站。药学、公共卫生与预防医学、临床医学、生物学、基础医学等5个学科获批安徽省高等学校高峰学科。护理学、生物医学工程、心理与脑科学获批安徽省高峰培育学科立项建设。临床医学、药理学与毒理学、分子生物学与遗传学、生物与生物化学、免疫学、神经科学与行为学、社会科学总论、环境和生态学等8个学科进入ESI全球排名前1%。
安徽中医药大学，安徽中医药大学创建于1959年，其前身为1952年创立的安徽省中医进修班，2013年，教育部同意安徽中医学院更名为安徽中医药大学。学校是国家中医临床研究基地、国家中医药国际合作基地、国家药品临床研究基地，国家博士授权单位、硕士研究生推荐免试单位。有少荃湖、梅山路、史河路、六安路四个校区，全日制学生19502人（含博士生135人、硕士生3151人）。学校现有教职工4754人，其中副高以上职称人员961人。有国医大师2人，国家杰青1人，岐黄学者1人，全国名中医4人，青年岐黄学者3人，皖江学者1人，青年皖江学者3人，省特支计划创新领军人才10人，省杰青5人，省优青4人，国家名老中医学术经验项目指导教师56人，享受国务院特殊津贴27人、省政府特殊津贴12人，安徽省领军人才团队3个，省“115”产业创新团队8个。直属附属医院：安徽中医药大学第一附属医院、第二附属医院、第三附属医院。
皖南医学院，皖南医学院地处素有“长江巨埠、皖之中坚”之称的历史名城—芜湖市，濒临浩瀚长江，汇集江南神秀。学校建于1958年，时为芜湖医学专科学校；1971年并入安徽医学院，为安徽医学院皖南分院；1974年经国务院批准独立建校，命名为皖南医学院。学校现有教职医护员工5720人（含直属附院），专任教师1028人，高级职称1004人。直属医院：皖南医学院第一附属医院（皖南医学院弋矶山医院）、皖南医学院第二附属医院（宣城地区人民医院）。非直属附属医院：芜湖市第二人民医院、黄山市人民医院、马鞍山市人民医院、马鞍山市中心医院、池州市人民医院、铜陵市人民医院、中国人民解放军联勤保障部队第901医院、芜湖市第一人民医院、上海市第五人民医院、安庆市第一人民医院。
蚌埠医学院，蚌埠医学院坐落于淮河流域重要的交通枢纽城市——蚌埠，濒临千里淮河，承山水涵养之灵气，传杏林济世之流芳,现有龙子湖校区、治淮校区、宏业校区、淮上校区和高铁校区，占地面积1751.8亩，学校现有教职医护员工近6000人（含直属附属医院），专任教师1054人，其中教授179人、副教授392人，硕士生导师909人、联合培养单位博士生导师29人，具有博士学位的教师322人，硕士学位的教师644人。附属医院：蚌埠医学院附属第一医院（附属肿瘤医院）、蚌埠医学院附属第二医院、蚌埠医学院直属淮北人民医院、蚌埠医学院附属蚌埠第三人民医院（蚌埠市中心医院）。
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